Pffff wi forcément je pige mieux il a modifié les droits d'accès répertoires et fichiers, et ca se répercute aussi sur les délais d'exécutions des scripts....
A mon avis le + simple pour rectifier le tir, serait de désinstaller ton paquet apache, reboot ton serveur linux, afin que tout se réinitialise correctement, et refais une installation de ton paquet apache avec ses dépendances...
Et dis a ton collègue de ne plus mettre ses pattes sur ton compte.
Remet par rapport a ton compte les accès amin pour ton administration apache, ca devrait rentrer dans l'ordre.
J'espère pour toi.